Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF1AQ16665 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF1AQ16665 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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