Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABPB1Q06547 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms