Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms