Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PLNP26678 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PLNP26678 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PLNP26678 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PLNP26678 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PLNP26678 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PLNP26678 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms