Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMED7Q9Y3B3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms