Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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