Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT172Q9UG01 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms