Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS2Q9NYR9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms