Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSHZ2Q9NRE2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSHZ2Q9NRE2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms