Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EBF4Q9BQW3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms