Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG3Q96JB2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG3Q96JB2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms