Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms