Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 DDX52-209ENST00000612255 2027 ntTSL 23.15□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 31
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PRPF8Q6P2Q9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 30.8
PRPF8Q6P2Q9 SCO1-205ENST00000582053 565 ntTSL 44.21□□□□□ -1.746e-9■■■■■ 30.8
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PRPF8Q6P2Q9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 30.8
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PRPF8Q6P2Q9 BRPF3-203ENST00000441123 5380 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 30.8
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PRPF8Q6P2Q9 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 30.8
PRPF8Q6P2Q9 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -19e-7■■■■■ 30.8
PRPF8Q6P2Q9 BRPF3-209ENST00000532330 4077 ntTSL 58.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 30.8
PRPF8Q6P2Q9 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 30.8
PRPF8Q6P2Q9 TNPO2-209ENST00000588151 546 ntTSL 312.61□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 30.8
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