Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATL3Q6DD88 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms