Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECM29Q5VYK3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms