Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms