Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTPRRQ15256 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRRQ15256 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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