Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLCA4Q14CN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms