Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LAMA5-203ENST00000370691 3160 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.045e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 HSD17B10-205ENST00000495986 666 ntTSL 523.46■■□□□ 1.359e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.081e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.011e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.981e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 217.31■□□□□ 0.367e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.985e-9■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.233e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 LYRM4-203ENST00000458438 941 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MZT2B-207ENST00000485869 583 ntTSL 227.18■■□□□ 1.944e-9■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 PSME2-206ENST00000559042 643 nt16.2■□□□□ 0.182e-9■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-204ENST00000598057 662 nt22.17■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-202ENST00000595226 725 ntTSL 221.4■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-206ENST00000600292 653 ntTSL 221.22■□□□□ 0.991e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RABAC1-207ENST00000601028 530 ntTSL 219.1■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.032e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-206ENST00000536241 1490 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-208ENST00000540683 985 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-201ENST00000229265 1047 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-204ENST00000535406 1327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CDCA3-209ENST00000544610 624 ntTSL 37.9□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.074e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-209ENST00000534333 453 ntTSL 223.07■■□□□ 1.284e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.134e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-206ENST00000530791 837 ntTSL 221.79■■□□□ 1.084e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.994e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.624e-12■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.345e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 222.88■■□□□ 1.255e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 322.88■■□□□ 1.255e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 520.77■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 320.48■□□□□ 0.875e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 320.31■□□□□ 0.845e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.545e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.565e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.964e-25■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KLHDC8B-203ENST00000462582 832 ntTSL 520.68■□□□□ 0.94e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.684e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 222.66■■□□□ 1.224e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.754e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.954e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.824e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.463e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.463e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.165e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.45e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ELOB-201ENST00000262306 582 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.545e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ELOB-204ENST00000494946 472 ntTSL 210.61□□□□□ -0.715e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NCLN-203ENST00000587740 1210 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NCLN-208ENST00000592737 2735 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NCLN-206ENST00000591062 460 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 38.8□□□□□ -11e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 515.91■□□□□ 0.143e-11■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 524.67■■□□□ 1.541e-46■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.327e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.447e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.547e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 GATAD2B-211ENST00000637918 1027 ntTSL 513.67□□□□□ -0.228e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.338e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 PRDX6-203ENST00000470017 859 ntTSL 28.66□□□□□ -1.026e-43■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.672e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.942e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.742e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 224.88■■□□□ 1.572e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.123e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 525.6■■□□□ 1.693e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.033e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 519.49■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 ZNF428-202ENST00000595304 569 ntTSL 229.44■■■□□ 2.32e-6■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.294e-19■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.644e-19■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.524e-19■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.154e-19■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.275e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.215e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.955e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.415e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.495e-10■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SARS2-206ENST00000594259 690 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MPDU1-208ENST00000571877 1195 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.249e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)22.96■■□□□ 1.271e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 RPL32-208ENST00000457131 555 ntTSL 26.86□□□□□ -1.312e-38■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 15.6
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