Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTP4A2Q12974 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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