Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GABPB1Q06547 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms