Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPIPB9F8W1W9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms