Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WIPF3A6NGB9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms