Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG6Q9Y2V7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms