Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms