Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
YTHDF1Q9BYJ9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
YTHDF1Q9BYJ9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms