Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FYCO1Q9BQS8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms