Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms