Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM44Q96DX7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM44Q96DX7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms