Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBXN4Q92575 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms