Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNBP2Q8WZ74 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms