Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVOPQ8N4V2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms