Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3F3CQ6NXT2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms