Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SAMD9Q5K651 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms