Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSX1Q16384 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SSX1Q16384 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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