Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF2Q12947 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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