Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNA3P52797 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms