Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms