Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL2P13500 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL2P13500 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms