Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
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