Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRGAP3O43295 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms