Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIPSLA2A3N6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms