Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms