Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SAMM50Q9Y512 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SAMM50Q9Y512 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SAMM50Q9Y512 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms