Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFG3L2Q9Y4W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFG3L2Q9Y4W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms