Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NRXN3Q9Y4C0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NRXN3Q9Y4C0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NRXN3Q9Y4C0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NRXN3Q9Y4C0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms