Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAB1Q9Y478 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB1Q9Y478 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms