Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q9Y3F1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9Y3F1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Q9Y3F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9Y3F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9Y3F1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Q9Y3F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9Y3F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9Y3F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9Y3F1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9Y3F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q9Y3F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Q9Y3F1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Q9Y3F1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Q9Y3F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Q9Y3F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9Y3F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9Y3F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9Y3F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Q9Y3F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9Y3F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9Y3F1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9Y3F1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q9Y3F1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q9Y3F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms