Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP3Q9Y2W7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP3Q9Y2W7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms