Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF3IP3Q9Y228 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP3Q9Y228 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP3Q9Y228 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms